Der Name JMC, abgeleitet von James Marson Cook währte nicht lange am Airlinerhimmel.
Die Gesellschaft entstand am 1.9.1999 durch die Fusion von Caledonian Airways und Flying Colours Airlines, die beide unter dem Dach der Thomas Cook Holding operierten.
JMC übernahm vollständig die Aufgaben der Vorgängergesellschaften und setzte hierbei Boeing B-757, McDonnell Dougals DC-10, sowie den Airbus A-330 und A-320 ein.
Die deutsche C & N Touristik AG übernahm im Frühjahr 2001 die Thomas Cook Holding. Sie arbeitete fortan an einen einheitlichen Auftritt der Fluggesellschaften JMC, Condor und Thomas Cook Belgien.
Im Herbst 2002 einigte man sich auf den Namen Thomas Cook, verbunden mit der Vereinheitlichung der Bemalung an den Flugzeugen der genannten Gesellschaften.
Am 1.5.2003 wurde das Konzernprogramm gegen einen nicht unerheblichen Widerstand der Mitarbeiter, aber auch der Bevölkerung der einzelnen Länder durchgesetzt und der Name JMC verschwand.