Der Congo und die belgische Sabena gründeten am 28.6.1961 die Fluggesellschaft Air Congo. Sabena und Air Congo stimmten ihre Strecken aufeinander ab und so entstand innerhalb kurzer Zeit ein ausgedehntes Streckennetz das mit Beech-18, Douglas DC-3, DC-4 und DC-6 beflogen wurde.
Ab 1965 übernahm der Congo die Fluggesellschaft und führte sie in Eigenregie. Als erstes wurden die alten Flugzeuge durch Caravelle und DC-8 ersetzt.
1971 nannte sich der Staat in Zaire um und auch die Fluggesellschaft erhielt zum 25.10.1971 den neuen Namen Air Zaire.
Zwei Jahre später gelangte eine DC-10 zur Airline die auf regelmäßige Liniendienste nach Europa eingesetzt wurde. Für das Inlandnetz standen Fokker F-27 und Boeing B-737 zur Verfügung.
Die kühne Entscheidung die Fluggesellschaft in Eigenverantwortung zu führen war nicht gut, denn zu keinem Zeitpunkt war Air Zaire kostendeckend.
Die Schulden wurden für den Staat so hoch, so dass man sich entschloss Air Zaire zum 12.6.1995 aufzulösen.