Diese, am La Aurora Int. Airport in Guatemala Stadt ansässige Airline wurde im März 1989 gegründet.
Mit einer zum Frachter umgerüsteten Convair CV-580 flog man ab Februar 1990 regelmäßig den Mundo Maya Int. in Flores an.
Ab Mai 1991 leaste die Gesellschaft eine Douglas DC-9-15 mit der Passagiere nach Cancun, San Pedro Sula und Puerto Barrios befördert wurden.
Im September des gleichen Jahres mietete Aeroquetzal für drei Monate einen Airbus A-320 von LACSA den man auf der neuen Los Angeles Route einsetzte.
Finanzielle Probleme zwangen Aeroquetzal im April 1992 zur Einstellung jeglicher Aktivitäten und zur Rückgabe aller verbliebenen Flugzeuge an die Leasinggeber.